Historia IX Liceum Ogólnokształcącego im. Krzysztofa Kolbergera w Gdańsku rozpoczęła się 1 września 1951 roku. Szkoła powstała jako Państwowa Szkoła Ogólnokształcąca nr 1 – szkoła ćwiczeń dla studentów Państwowej Wyższej Szkoły Pedagogicznej przy ul. Sobieskiego we Wrzeszczu. Jej organizatorką i pierwszą dyrektorką była Emilia Nawrocka. Początki były bardzo skromne – szkoła dysponowała jedynie dwiema salami lekcyjnymi i pokojem nauczycielskim, a kadrę stanowili wykładowcy uczelni.
Już w 1954 roku odbyła się pierwsza matura, którą zdało 24 uczniów. Rok później szkołę przeniesiono do nowego budynku przy ul. Nowotki na Strzyży. W tym okresie zaczęła dynamicznie się rozwijać – liczba uczniów szybko rosła, a szkoła zyskała własną tożsamość i wyjątkowy klimat.
W latach 50. i 60. ważnym elementem życia szkoły stała się działalność artystyczna. Powstał legendarny szkolny kabaret „SYFON”, związany m.in. z późniejszym patronem szkoły – Krzysztofem Kolbergerem. Działał także szkolny Zespół Pieśni i Tańca, organizowano koncerty artystów Opery i Filharmonii Bałtyckiej, a szkoła jako jedna z pierwszych w województwie uruchomiła klasę o profilu matematycznym.
W 1962 roku liceum zostało przeniesione do nowoczesnego budynku przy ul. Bażyńskiego w Oliwie, wybudowanego w ramach ogólnopolskiej akcji „Tysiąc szkół na Tysiąclecie Państwa Polskiego”. Wówczas nadano szkole imię Giuseppe di Vittorio. Kolejna przeprowadzka nastąpiła w 1970 roku – tym razem do obecnej siedziby przy ul. Wilka-Krzyżanowskiego 8 we Wrzeszczu.
Lata 70. były okresem intensywnego rozwoju szkoły. Rosła liczba uczniów, sukcesy maturalne i osiągnięcia olimpijskie. W 1976 roku, podczas obchodów 25-lecia, szkoła otrzymała pierwszy sztandar ufundowany przez rodziców oraz zakłady opiekuńcze. W tym samym roku odbył się pierwszy zjazd absolwentów.
W latach 80. szkoła była miejscem ważnych wydarzeń społecznych i obywatelskich. W 1984 roku IX LO otrzymało Medal UNESCO za wkład w wychowanie dla pokoju. W tym samym czasie w szkole działała Gdańska Federacja Młodzieży Walczącej oraz wydawano opozycyjne pismo „Monit”.
Po przemianach ustrojowych 1989 roku szkoła weszła w nowy etap swojej historii. Zmienił się charakter edukacji, wprowadzono naukę języków zachodnich, rozszerzono ofertę zajęć i rozwijano partnerskie relacje między nauczycielami a uczniami. Od 1993 roku z sukcesami działała w szkole Odyseja Umysłu, a od 1995 roku realizowano międzynarodowy program edukacyjny SOKRATES.
W latach 2002–2019 szkoła funkcjonowała jako trzyletnie liceum ogólnokształcące. Od 1 września 2019 roku, zgodnie z reformą systemu edukacji, IX LO ponownie stało się liceum czteroletnim.
21 stycznia 2015 roku patronem szkoły został wybitny aktor i absolwent liceum – Krzysztof Kolberger. Od tego czasu ważnym elementem życia szkoły stała się także Kolbergeriada – gra szkolna popularyzująca wiedzę o patronie i historii „Dziewiątki”.
W ostatnich latach szkoła przeszła dużą modernizację technologiczną i infrastrukturalną. Sale wyposażono w nowoczesny sprzęt multimedialny, tablice interaktywne, drukarki 3D i pracownie komputerowe. Rozwijana jest również działalność sportowa, artystyczna i międzynarodowa. Szczególne znaczenie mają projekty Erasmus+, dzięki którym uczniowie i nauczyciele uczestniczą w wymianach zagranicznych oraz projektach edukacyjnych w całej Europie.
Od 2023 roku funkcję dyrektora szkoły pełni Zygmunt Pilarek, kontynuując rozwój szkoły oparty na relacjach, nowoczesnej edukacji i aktywnym zaangażowaniu społeczności szkolnej. Współpraca dyrekcji, nauczycieli, samorządu uczniowskiego oraz rady rodziców przekłada się na liczne inicjatywy uczniowskie, takie jak konferencja „Nasze Sprawy – Twoja Przyszłość” czy Talent Show.
Dziś IX Liceum Ogólnokształcące im. Krzysztofa Kolbergera jest nowoczesną szkołą z bogatą tradycją, silnie związaną z historią Gdańska i kolejnymi pokoleniami swoich absolwentów.
